从实验室到Nature子刊,他说在复旦可以“全身心沉浸科研”


秋日的复旦园里,“相辉同游”第二期午餐会正在举行。2022级计算与智能创新学院本科生韩创意作为国家自然科学基金委青年学生项目(本科生)(下文简称:国自然本科生项目)获得者,为相辉学堂的学弟学妹带来了一场轻松而充实的分享。

从AI大模型的工业落地挑战,到细胞数据的解析技巧,从课程选择策略到科研心态的培养,都知无不言,也让人不禁好奇:他是如何在短短两年里,从科研“小白”成长为一位手握国家级科研项目、以第一作者身份在《自然·机器智能》(Nature Machine Intelligence)发表论文的直博生?
在复旦,科研之门为本科生早早打开
韩创意的科研之路,始于大二下学期。在一次国际人类表型组大会上,他作为志愿者负责接待一位美国科学院院士。“在陪同的一个小时里,我们聊科研、谈人生,那位院士告诉我:‘趁着现在平台好,早点开始做科研,而且要做就做最前沿的。’”
这个建议如同在年轻学子心中种下了一颗种子。回到校园后,韩创意立即开始寻找研究方向,最终锁定了空间组学这个前沿领域。更让他惊喜的是,在复旦,这个领域的前沿学者就在身边。

“我很快发现原致远研究员正是这一领域的前沿学者,恰逢原老师开设相关课程。”随即,韩创意便主动选课,随后加入课题组,开启了“空间组学与人工智能交叉领域”的探索。
“不要认为自己基础差、还没准备好,”回顾自己的起步,他对学弟学妹这样建议,“找到一个感兴趣的方向后,尽快联系老师,早点开始,在实践中学习是成长最快的方式。”
复旦的科研训练体系,为他这样的探索者提供了坚实的第一级台阶。在导师指导下,他先主持了复旦大学“复芏计划”下设的“䇹政项目”——大规模空间组学数据细胞微环境识别模型开发,并以优秀结题。这个“量身打造”的入门项目,让他初探科研训练,掌握领域内的基本计算工具,对科研流程也有了把握。
从Nature子刊到国自然本科生项目,品味与毅力是关键词
扎实的入门训练后,韩创意迎来了第一个重大挑战——探索自监督学习模型从单细胞数据到空间转录组数据的可迁移性。这项研究最终被《自然·机器智能》(Nature Machine Intelligence)接收,他也成为了中国首位以本科生第一作者身份在该刊发表研究论文(Research Article)的学生。
然而,科研之路从不平坦。
“投稿后,因为我们的研究相对整个领域较为前沿,有审稿人对我们的部分研究动机与技术细节提出了一系列疑问。”韩创意回忆道。
面对挑战,他和团队没有退缩。他们花了整整两个月,写了六十多页相当于中文十多万字的审稿意见回复信,回忆起这段经历,韩创意感触颇深。“我们针对审稿意见补了七八个实验,从理论和实验两个层面有力回应了审稿人的疑问。”
“这个过程让我深刻体会到,选择一个有价值的科学问题,就像扣好科研的第一粒扣子。”韩创意说,“问题选对了,后续的努力才会水到渠成。这种对问题价值的判断,就是科研的‘品味’与‘眼光’。”

“世界上最伟大的科学家和艺术家,都在做着突破认知与审美界限的事情。”他进一步说,“爱因斯坦、达芬奇如此,今天的科研工作者亦然。”
这份在实战中磨练出的“品味”与坚韧,也成为他获得“国自然”本科生项目青睐的关键。他成功申请到面向空间组学数据相关项目。
他用一个生动的类比解释自己的研究:“就像我们既有图片又有文字,希望把两者对齐、互相生成。我们的目标是整合RNA、蛋白质等不同模态的空间数据,构建一个‘虚拟空间多组学图谱’,相当于为研究者提供一组多视角的‘计算显微镜’,更全面地洞察生命机制。”
如果项目推进顺利,将突破当前实验技术的限制,从计算方法上实现对细胞状态与微环境更全面的洞察,为肿瘤免疫、神经退行性疾病、发育生物学等前沿领域提供新的分析工具。
复旦土壤,托举本科生的科研梦想
韩创意的快速成长,并非孤例,其背后是复旦大学为本科生科研构建的丰沃土壤。
“在复旦,本科生能够获得这样强大的导师团队指导,这是非常难得的机会。”韩创意称自己是幸运的,除了原致远的指导外,他也曾接受中国科学院院士金力、计算与智能创新学院首席教授施伯乐的指导。
“两位老师都十分乐意给我这个科研新手一些高屋建瓴的建议,而原致远老师则提供了更具体的指导。”

“原老师会非常看重实验结果背后的科学逻辑以及对实验结果的呈现方式。”韩创意说,“老师要求我们每一张图表都需要准确、清晰地传达科学发现,不能有任何含糊或误导。督促我们常思考和反复推敲:这个数据真正说明了什么?这样呈现是否能让同行准确理解我们的发现? 所以,我们每一张图可能都会要改个十几版最后才将它呈现在论文当中。”这种对科学严谨性的执着追求,也让韩创意明白科研不仅要做得扎实,更要对自己的每一个结论以及科研成果的传播负责。
在论文写作中,原致远也特别强调逻辑线的把握。“我们可以语言不够流畅,但是逻辑一定要把握得非常清晰。”这种训练让韩创意认识到,动机阐述和逻辑清晰是一篇论文最重要的两个支点。
他特别提到《计算机组成原理》课程的授课教师张为华。“老师允许我们把更多时间投入科研探索,这种包容对我们非常重要。”这种鼓励学生追求个性化发展的氛围,在复旦的课堂上并不少见。
“在复旦,开放的学术交流,也极大地拓展了我的学术视野,帮助我锚定前沿方向。”通过“复芏计划”等平台,韩创意可以接触到各类前沿学术报告。无论是作为志愿者还是听众参与高端学术会议,都可以让他收获满满。
希望未来能构建“虚拟细胞”系统
被问及“典型的科研日常”时,韩创意描述得简单而专注:早上九点前到工位,看文献、跑实验、调试代码、整理结果,晚上十一点左右离开。“一周大概工作六到七天。基本上除了休息,就是泡在工位上。”他笑着说。

入选“国自然”本科生项目后,他对未来的科研道路更加清晰。如今,他已入选复旦大学类脑智能科学与技术研究院2026级直博生,将在空间多组学与人工智能的交叉领域继续深耕。他希望未来自己能够,参与到构建“虚拟细胞”甚至“虚拟人体”的宏伟目标中,“为理解生命、对抗疾病提供全新的视角和工具。”
在这个系统中,许多实验无需在实体动物或人体上进行,这将极大推进医学发展和生命机制的理解。“这是一个最终极的目标,”他笑着说,“还有非常多人都在为着这样一个目标所努力。我也希望自己在这个过程突破一些认知上的界限,开拓一些知识的荒原”。
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